重慶適合種植的中藥材有墊江的丹皮、秀山的白術、石柱的黃連、江津的銀花、綦江的木瓜、巫溪的大寧黨參、巫溪太白貝母、補骨脂、川佛手、粉葛等等；適合重慶高山地區種植的藥材有很多,例如白術、玄參、百合、黃連、何首烏、伸筋草、當歸、天等等。

1.墊江的丹皮

丹皮，又名牡丹皮，中藥名。為毛茛科植物牡丹干燥根皮。產于安徽、山東、重慶等地。秋季采挖根部，除去細根，剝取根皮，曬干。生用或炒用。《本草綱目》：“滋陰降火，解斑毒，利咽喉，通小便血滯。后人乃專以黃蘗治相火，不知丹皮之功更勝也。赤花者利，白花者補，人亦罕悟，宜分別之。”現代研究，所含牡丹酚及其以外的糖苷類成分均有抗炎作用；牡丹皮的甲醇提取物有抑制血小板作用；牡丹酚有鎮靜、降溫、解熱、鎮痛、解痙等中樞抑制作用及抗動脈粥樣硬化、利尿、抗潰瘍等作用。

2.秀山的白術

白術是秀山傳統中藥材，具有健脾益氣，燥濕利水，止汗，安胎。用于脾虛食少，腹脹泄瀉，痰飲眩悸，水腫，自汗，胎動不安。土白術健脾，和胃，安胎。用于脾虛食少，泄瀉，胎動不安。水源村空氣濕潤、土壤肥沃、水源充沛、氣候適宜，白術個體大，含藥量高，產品暢銷國內各大中藥材市場。

3.石柱的黃連

石柱黃連，重慶市石柱土家族自治縣特產，中國國家地理標志產品（原產地域產品）。因產產于該縣黃水森林公園，也稱“黃水黃蓮”。為毛茛科黃連屬植物黃連Coptis chinensis Franch.，藥材商品為“味連”，系常用名貴中藥，石柱縣是黃蓮的原始產區、中國黃蓮之鄉，所產因品質優良，被確定為“國藥”“地道黃蓮”。

4.綦江的木瓜

綦江木瓜又稱萬壽果、百益果。綦江木瓜已有上百年種植歷史，綦江區先后投資了上億元資金，成功打造了中國最大的10萬畝優質藥用木瓜基地；并已取得國家無公害木瓜產品產地認證，正在申報國家綠色食品認證基地，2011年被命名為中國優秀木瓜之鄉；木瓜樹的平均生命周期在100年以上。

5.巫溪的大寧黨參

巫溪境內山大坡陡，河谷縱橫，海拔1500—2500米的高寒地帶，云霧繚繞，土壤疏松，深厚肥沃，特別適宜黨參生長,且無工農業污染，農業環境質量達標.因巫溪古稱大寧，所產天然黨參被稱為“大寧黨”，為純天然綠色產品。 大寧黨參是在巫溪特殊的高山生態環境，經長期的自然選擇逐步形成的珍貴地方藥材品種，屬川黨范疇，獨具“味甘氣濃、皮肉緊湊、嚼之渣少、滋補力強”的鮮明特色，為參中珍品。

6.巫溪的太白貝母

巫溪中藥材產業已經形成比較完整的產業鏈條。中藥材在地面積發展至15萬畝以上，較2013年增長15%，其中種源基地5萬余畝，商品示范基地3.02萬畝，大寧黨參和太白貝母種分別達到15962畝、621畝，較2013年分別增長30%和85%。